O CEA oferece, regularmente, cursos de metodologias de investigação em Ciências Sociais e Humanas destinados a estudantes, investigadores e demais interessados. O objectivo dos cursos consiste em assegurar que os participantes apropriem-se dos fundamentos epistemológicos e das ferramentas necessárias para a concepção, o desenho e a implementação de projectos de investigação. Os cursos têm uma componente prática e são organizados com referência a temas relevantes e de interesse nacional, regional ou continental. No contexto das actividades de cada sessão são definidos exercícios práticos específicos e outras actividades consideradas relevantes de modo a garantir que os participantes adquiram competências práticas e teóricas sobre a investigação social.